Créée en 2003, la FECONG est une structure de 3è degré dans la mesure où elle regroupe des collectifs d’ONG parmi lesquels : la SECO-ONG (collectifs des ONG maliennes, la CAFO (collectifs d’ONG et d’associations de femmes), le CCA ONG (qui regroupe ONG nationales et internationales), le groupe pivot éducation de base, le groupe pivot santé/population et les collectifs régionaux des huit régions du pays.